20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0311 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0311  tRNA intron endonuclease domain-containing protein  100 
 
 		 193 aa  386  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.57 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.1 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.48 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.48 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  37.09 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.1 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  31.41 
 
 		 351 aa  68.2  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  32.26 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  33.13 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0450  tRNA intron endonuclease  24.71 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000001619 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  28.81 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  34.27 
 
 		 351 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  31.94 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1256  tRNA intron endonuclease, catalytic domain protein  32.94 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  31.1 
 
 		 352 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  34.81 
 
 		 375 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1747  tRNA intron endonuclease, catalytic-like protein  29.6 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.817286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  29.45 
 
 		 348 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  28.65 
 
 		 348 aa  44.7  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>