106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1703 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  93.89 
 
 		 131 aa  253  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  86.26 
 
 		 131 aa  239  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  88.55 
 
 		 131 aa  239  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  71.76 
 
 		 131 aa  201  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  47.37 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  47.9 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  48.06 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  46.34 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  51.56 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  45.38 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  46.15 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  47.9 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  44.62 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  44.62 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  43.7 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  43.86 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  41.09 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  40.34 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  42.02 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  40 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  38.6 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  36.13 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  38.74 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  38.26 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  37.84 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  35.83 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  35.09 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  36.63 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  33 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  35.56 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  31.53 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  38.2 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  34 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  35.96 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  30.84 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  34.38 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  31.78 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  31.78 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  34.74 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  31.78 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  29.21 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  36.08 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  36.08 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  36.08 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  31.11 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  35.16 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  33.71 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  29.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  31.46 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  33.71 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  30.34 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  32.58 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  33.68 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  31.46 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  31.82 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  30.34 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  28.41 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  32.58 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  28.81 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  29.82 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  32.56 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  30.68 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  31.82 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  32.63 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  30.68 
 
 		 211 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  32.14 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  31.46 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  31.82 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  30.34 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  32.58 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  32.5 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  31.58 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  29.07 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  31.58 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  31.65 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0519  translation elongation factor P  28.57 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  30.34 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  31.46 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  30.93 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  37.97 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  32.14 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  30.68 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  32.14 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  30.68 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  28.3 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  30.77 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  29.55 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  33.01 
 
 		 185 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  29.55 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  30.68 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  30.11 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  29.17 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  29.76 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  29.55 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  29.81 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  30.34 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  28.09 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  32.14 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  29.55 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>