34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1604 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  100 
 
 		 124 aa  255  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  89.52 
 
 		 124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  81.45 
 
 		 125 aa  216  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  79.03 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  77.42 
 
 		 124 aa  201  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  49.59 
 
 		 125 aa  136  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  47.97 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  47.15 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  49.59 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  45.53 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  48.41 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  44.53 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  43.2 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  46.96 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  44.35 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  44.53 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  46.51 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  46.51 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  45.74 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  45.31 
 
 		 132 aa  105  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  44.34 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  40.62 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  40.34 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  41.22 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  36.13 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  37.84 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  38.74 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  36.04 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  32.53 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  33.65 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  29.81 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  32.08 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  29.76 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  28.09 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>