47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1949 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  74.05 
 
 		 131 aa  214  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  61.36 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  59.09 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  59.09 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  59.09 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  52.31 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  54.96 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  50 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  48.44 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  47.2 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  47.15 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  42.42 
 
 		 136 aa  120  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  46.34 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  46.34 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  44.72 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  46.09 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  44.53 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  47.66 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  42.62 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  45.45 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  40.98 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  39.34 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  40.16 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  40.83 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  44.17 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  36.89 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  38.46 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  36.84 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  31.43 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  40 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  32.43 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  35.9 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  29.03 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  31.19 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  31.58 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  29.81 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  31.58 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  32.43 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  32.43 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0519  translation elongation factor P  29.35 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  35.11 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  32.98 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  32.98 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  32.98 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4726  translation elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0198786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>