35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1578 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 125 aa  259  8.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  81.45 
 
 		 124 aa  216  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  78.23 
 
 		 124 aa  206  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  74.19 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  74.19 
 
 		 124 aa  196  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  45.53 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  47.97 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  49.17 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  45.53 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  46.28 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  48 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  40.65 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  45.45 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  48 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  47 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  41.6 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  52.08 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  49 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  55.17 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  48.48 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  50.57 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  45.92 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  38.6 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  40.71 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  35.09 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  35.96 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  35.14 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  34.26 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  28.71 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  33.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  31.63 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  30.61 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  28.21 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  28.57 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  28.24 
 
 		 185 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>