38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1897 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 127 aa  256  8e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  69.29 
 
 		 128 aa  193  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  61.6 
 
 		 125 aa  169  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  59.06 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  61.6 
 
 		 125 aa  166  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  60.32 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  58.4 
 
 		 125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  57.38 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  51.97 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  54.47 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  50.41 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  48.78 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  49.59 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  47.97 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  52.85 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  49.59 
 
 		 132 aa  120  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  50.41 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  49.59 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  40.98 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  43.33 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  44.63 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  48.54 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  40.83 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  40.46 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  40.34 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  38.26 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  35.29 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  37.39 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  34.38 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  32.26 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  34.02 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  33.67 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  28.23 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  29.67 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  29.67 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  28.57 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  28.57 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  28.57 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>