78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0199 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  93.89 
 
 		 131 aa  253  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  90.08 
 
 		 131 aa  244  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  90.08 
 
 		 131 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  73.28 
 
 		 131 aa  202  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  45.86 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  47.29 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  46.22 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  44.72 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  44.62 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  43.85 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  47.66 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  44.54 
 
 		 125 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  44.27 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  43.08 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  41.18 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  44.14 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  37.98 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  40.54 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  36.97 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  39.5 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  38.26 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  36.13 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  38.74 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  37.39 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  37.84 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  35 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  35.14 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  33.66 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  33 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  35.56 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  32.43 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  34 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  37.5 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  35.23 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  30.19 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  29.91 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  32.18 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  30.34 
 
 		 185 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  28.97 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  28.97 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  31.58 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  28.95 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  32.99 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  32.99 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  32.99 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  30.91 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  31.87 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  29.55 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  31.46 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  29.21 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  30.34 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  31.46 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  31.46 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  32.58 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  31.82 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  31.46 
 
 		 187 aa  43.5  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  32.63 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  32.91 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  30.59 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  31.03 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  31.33 
 
 		 185 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  31.46 
 
 		 204 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  28.41 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  33.01 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0519  translation elongation factor P  28.74 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  30.34 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  26.27 
 
 		 190 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  32.5 
 
 		 187 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  30.68 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  31.46 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  29.07 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  32.04 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  28.41 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  29.21 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  32.56 
 
 		 216 aa  40  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  30.23 
 
 		 187 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>