55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3103 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  100 
 
 		 124 aa  253  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  90.32 
 
 		 124 aa  233  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  81.45 
 
 		 124 aa  215  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  79.03 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  74.19 
 
 		 125 aa  200  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  48.41 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  48.78 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  46.34 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  44.72 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  46.34 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  44.72 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  43.55 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  48.7 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  46.09 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  43.75 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  46.09 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  47.29 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  47.29 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  44.96 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  43.75 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  44.62 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  37.98 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  38.6 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  40.54 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  36.13 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  40.57 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  36.97 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  36.04 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  32.63 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  38.75 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  35.9 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  32.61 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  38.2 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  35.96 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  33.75 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  36.08 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  34.83 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  35.05 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  34.83 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  37.08 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  34.83 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  31.46 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  30 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  32.58 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  29.91 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  29.17 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  28.57 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  29.89 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  28.89 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  27.78 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  28.09 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  24.72 
 
 		 187 aa  40  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  29.21 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  29.07 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  29.79 
 
 		 185 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>