36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0966 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  68.8 
 
 		 125 aa  184  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  68 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  65.08 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  66.4 
 
 		 127 aa  176  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  61.6 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  58.4 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  57.6 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  49.59 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  54.62 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  47.15 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  44.72 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  50 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  44.72 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  48.36 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  48.36 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  47.54 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  46.67 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  43.33 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  44.27 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  40.65 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  42.02 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  39.34 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  46.94 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  37.5 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  36.97 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  36.13 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  36.13 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  38.3 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  33.94 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  38.75 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  38.37 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  32.56 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  30.77 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  30.77 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  27.47 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>