More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3628 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  98.41 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  96.3 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  84.13 
 
 		 189 aa  327  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  84.13 
 
 		 189 aa  327  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  84.13 
 
 		 189 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  84.13 
 
 		 189 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  69.31 
 
 		 190 aa  269  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  60.32 
 
 		 188 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  60.32 
 
 		 188 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  57.14 
 
 		 188 aa  224  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  56.38 
 
 		 189 aa  214  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  53.59 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  51.6 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  53.97 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  55.03 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  51.06 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  53.44 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  51.96 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  52.38 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  51.93 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  49.47 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  53.44 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  51.1 
 
 		 188 aa  191  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  51.32 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  52.38 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  52.91 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  53.04 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  53.04 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  53.04 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  52.49 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  51.85 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  51.85 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  51.85 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  51.85 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  51.85 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  51.85 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  51.85 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  50.79 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  50.79 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  52.38 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  50.26 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  50.79 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  50.26 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  51.93 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  50.26 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  51.38 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  51.38 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  51.38 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  51.38 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  51.38 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  48.15 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  50.79 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  50.26 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  49.74 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  46.93 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  45.21 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  45.45 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  45.45 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  44.92 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  47.62 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  45.45 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  44.69 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  44.39 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  44.39 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  45.5 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  45.45 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  43.85 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  44.27 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  44.27 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  39.58 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  37.77 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  37.5 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  31.84 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  32.62 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  33.69 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  33.69 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  32.09 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  35.06 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  34.92 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  35.83 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  35.36 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  37.7 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  37.7 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  32.62 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  32.8 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  32.4 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  34.66 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  32.09 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  33.15 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  31.02 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>