More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1898 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  57.75 
 
 		 189 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  56.68 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  56.84 
 
 		 188 aa  217  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  54.84 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  54.84 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  57.53 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  56.99 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  55.32 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  56.15 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  53.72 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  50.27 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  51.61 
 
 		 188 aa  200  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  55.08 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  53.72 
 
 		 186 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  51.08 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  50 
 
 		 199 aa  197  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  53.76 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  48.92 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  48.66 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  53.72 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  52.66 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  52.66 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  53.19 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  53.19 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  53.19 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  52.66 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  48.92 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  52.66 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  52.66 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  47.59 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  48.39 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  46.52 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  49.46 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  47.85 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  47.85 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  47.85 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  48.39 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  47.85 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  47.31 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  46.77 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  49.46 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  47.31 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  45.99 
 
 		 190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  46.35 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  46.35 
 
 		 191 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  45.5 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  45.5 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  44.97 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  42.55 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  42.55 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  42.02 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  42.02 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  36.46 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  36.46 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  37.16 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  34.97 
 
 		 211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  35.52 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  32.24 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  33.51 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  33.88 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  30.6 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  35.14 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  34.43 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  31.75 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  30.6 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  33.15 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  30.81 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  34.97 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  32.79 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  31.94 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  34.07 
 
 		 185 aa  101  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  33.52 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  32.42 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  30.27 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  29.51 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  31.69 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  31.15 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  32.24 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  30.22 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  31.15 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>