More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1741 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  68.09 
 
 		 189 aa  280  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  68.62 
 
 		 188 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  67.55 
 
 		 189 aa  273  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  66.49 
 
 		 189 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  68.28 
 
 		 187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  65.96 
 
 		 188 aa  271  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  65.24 
 
 		 191 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  64.36 
 
 		 189 aa  268  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  65.96 
 
 		 188 aa  267  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  65.43 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  65.43 
 
 		 188 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  65.24 
 
 		 189 aa  265  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  63.83 
 
 		 189 aa  265  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  64.36 
 
 		 189 aa  264  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  264  5.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  63.83 
 
 		 190 aa  261  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  70.97 
 
 		 187 aa  260  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  63.83 
 
 		 190 aa  260  8e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  63.83 
 
 		 189 aa  257  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  63.83 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  61.7 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  61.7 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  63.49 
 
 		 191 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  63.83 
 
 		 189 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  250  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  250  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  250  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  250  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  250  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  60.64 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  62.77 
 
 		 188 aa  248  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  62.23 
 
 		 191 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  60.11 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  60.11 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  60.11 
 
 		 188 aa  244  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  60.11 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  60.11 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  60.11 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  56.38 
 
 		 188 aa  228  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  56.38 
 
 		 187 aa  224  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  50.79 
 
 		 189 aa  210  9e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  53.19 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  50.27 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  54.95 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  50.53 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  48.09 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  48.09 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  45.9 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  41.94 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  47.06 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  47.54 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  47.06 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  47.06 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  47.06 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  45.95 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  44.86 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  46.15 
 
 		 187 aa  171  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 187 aa  171  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  47.25 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  46.45 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  47.28 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  44.51 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  42.7 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  44.81 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  46.24 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  44.51 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  45.45 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  45.05 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>