More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2035 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  92.43 
 
 		 185 aa  351  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  84.86 
 
 		 185 aa  325  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  303  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  297  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  79.35 
 
 		 185 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  77.72 
 
 		 185 aa  293  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  77.17 
 
 		 185 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  77.17 
 
 		 185 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  76.63 
 
 		 185 aa  291  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  76.09 
 
 		 185 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  76.09 
 
 		 185 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  76.09 
 
 		 185 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  72.83 
 
 		 186 aa  284  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  71.74 
 
 		 184 aa  283  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  73.37 
 
 		 186 aa  280  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  75 
 
 		 186 aa  279  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  72.28 
 
 		 186 aa  279  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  72.83 
 
 		 186 aa  278  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  70.11 
 
 		 199 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  71.2 
 
 		 184 aa  275  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  71.2 
 
 		 188 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  70.11 
 
 		 184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  70.11 
 
 		 184 aa  271  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  70.11 
 
 		 184 aa  271  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  70.65 
 
 		 184 aa  271  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  70.65 
 
 		 184 aa  271  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  66.85 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  65.41 
 
 		 189 aa  265  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  66.85 
 
 		 184 aa  264  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  67.39 
 
 		 184 aa  264  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  64.71 
 
 		 188 aa  259  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  64.71 
 
 		 188 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  64.71 
 
 		 188 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  62.7 
 
 		 186 aa  243  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  61.83 
 
 		 186 aa  241  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  63.1 
 
 		 188 aa  241  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  60.54 
 
 		 186 aa  241  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  60.22 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  234  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  58.92 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  61.83 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  61.9 
 
 		 191 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  61.9 
 
 		 191 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  60.75 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  55.08 
 
 		 190 aa  214  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  57.53 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  53.97 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  52.66 
 
 		 189 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  52.13 
 
 		 189 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  52.13 
 
 		 189 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  52.66 
 
 		 189 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  53.44 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  53.44 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  42.02 
 
 		 190 aa  156  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  40.43 
 
 		 191 aa  147  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  41.08 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  42.16 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  38.12 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  37.5 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  38.04 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  40.88 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  40.88 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  40.88 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  40.88 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  40.88 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  40.33 
 
 		 190 aa  134  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  38.71 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  40.33 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  40.33 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  40.33 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  40.33 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  40.33 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  40.33 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  40.33 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  39.23 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>