More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1433 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  96.3 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  96.3 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  87.83 
 
 		 189 aa  340  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  84.13 
 
 		 189 aa  327  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  84.13 
 
 		 189 aa  327  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  70.74 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  56.91 
 
 		 188 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  56.91 
 
 		 188 aa  225  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  54.26 
 
 		 188 aa  217  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  55.08 
 
 		 189 aa  211  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  52.13 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  50.27 
 
 		 186 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  52.13 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  54.26 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  49.46 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  49.73 
 
 		 186 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  53.19 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  48.13 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  50.8 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  51.61 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  51.61 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  51.61 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  51.08 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  50.53 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  51.06 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  49.47 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  49.47 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  49.47 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  49.47 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  47.87 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  49.47 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  48.94 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  45.7 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  46.81 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  45.16 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  44.09 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  44.09 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  45.74 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  43.01 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  43.55 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  44.09 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  44.5 
 
 		 191 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  43.01 
 
 		 184 aa  164  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  43.01 
 
 		 184 aa  164  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  44.5 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  43.01 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  43.55 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  42.55 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  33.87 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  32.26 
 
 		 186 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  31.72 
 
 		 190 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  32.26 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  32.28 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  36.13 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  34.57 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  31.72 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  34.76 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  32.8 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  32.26 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  33.7 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  33.69 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  34.04 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  32.8 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  32.8 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  31.18 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  32.8 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  31.55 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  31.55 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  36.07 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  36.81 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  36.81 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>