More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0077 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  59.56 
 
 		 187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  57.07 
 
 		 187 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  56.52 
 
 		 187 aa  238  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  59.46 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  55.68 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  57.61 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  57.61 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  57.61 
 
 		 187 aa  235  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  54.89 
 
 		 187 aa  228  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  50 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  50 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  49.47 
 
 		 190 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  217  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  50.54 
 
 		 189 aa  207  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  48.37 
 
 		 189 aa  205  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  50.27 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 186 aa  204  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  47.54 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  50 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  48.11 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  47.31 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  48.13 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  47.54 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  47.28 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  47.57 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  47.03 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  194  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  44.26 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  44.26 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  44.26 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  44.62 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  45.45 
 
 		 188 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  45.45 
 
 		 188 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  42.7 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  42.93 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  46.45 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  41.27 
 
 		 190 aa  187  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  45.36 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  187  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  43.24 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  44.32 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  44.68 
 
 		 194 aa  186  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  45.36 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  40.96 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  42.78 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  43.48 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  45.6 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  41.85 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  44.81 
 
 		 204 aa  184  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  43.41 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  47.25 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  42.39 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  42.39 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  42.39 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  44.81 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  43.89 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  45.36 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>