More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0996 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  82.63 
 
 		 191 aa  328  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  45.55 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  45.55 
 
 		 186 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  46.07 
 
 		 188 aa  164  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  45.74 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  45.79 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  45.55 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  42.02 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  45.03 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  42.02 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  42.02 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  42.02 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  44.21 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  41.49 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  43.09 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  43.16 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  42.41 
 
 		 188 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  44.74 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  42.02 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  43.68 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  44.21 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  43.09 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  40.96 
 
 		 184 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  46.07 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  42.02 
 
 		 184 aa  150  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  44.44 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  43.68 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  43.68 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  40.43 
 
 		 199 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  44.21 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  43.68 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  42.93 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  42.11 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  42.11 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  41.76 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  42.71 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  41.49 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  43.52 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  39.89 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  40.43 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  44.21 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  39.89 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  39.68 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  39.89 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  42.41 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  43.98 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  39.89 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  39.68 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  39.36 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  48.03 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  47.68 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  39.36 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  38.86 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  42.41 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  38.83 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  38.83 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  39.89 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  38.46 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  38.54 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  36.76 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  38.42 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  43.16 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  43.16 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  43.16 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  37.91 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  37.91 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  42.63 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  38.95 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  42.63 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  42.63 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  42.63 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  42.63 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  42.63 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  42.63 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  38.82 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  42.86 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  42.86 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  38.62 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  39.25 
 
 		 189 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  39.9 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  42.95 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  37.3 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  37.37 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  38.59 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  39.15 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>