More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2089 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  68.11 
 
 		 185 aa  275  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  63.24 
 
 		 185 aa  254  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  61.08 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  59.24 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  57.84 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  60 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  56.76 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  55.68 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  52.43 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  51.89 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  52.97 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  204  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  52.72 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  50.27 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  47.83 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  47.83 
 
 		 186 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  47.8 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  46.74 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  184  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  47.28 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  45.41 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  46.2 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  46.74 
 
 		 187 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  46.77 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  46.74 
 
 		 186 aa  180  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  46.2 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  46.2 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  44.32 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  45.95 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  44.02 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  43.78 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  45.65 
 
 		 186 aa  177  9e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  44.86 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  43.65 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  44.32 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  44.2 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  44.2 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  42.7 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  42.7 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  42.7 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  44.26 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  42.16 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  46.15 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  44.86 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  43.78 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  49.2 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  42.7 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  43.65 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  47.03 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  43.78 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  42.16 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  43.65 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  48.09 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  48.13 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  45.11 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  46.24 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  46.49 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  45.9 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>