More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0684 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  79.79 
 
 
189 aa  321  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  77.13 
 
 
189 aa  315  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  72.34 
 
 
188 aa  292  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  72.19 
 
 
187 aa  291  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  68.95 
 
 
190 aa  287  7e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  69.31 
 
 
190 aa  286  9e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  69.15 
 
 
188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  69.15 
 
 
188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  73.8 
 
 
187 aa  285  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  68.62 
 
 
189 aa  284  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  70.21 
 
 
188 aa  283  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  68.25 
 
 
191 aa  278  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  68.09 
 
 
188 aa  277  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  66.49 
 
 
189 aa  277  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  67.02 
 
 
189 aa  276  9e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  68.09 
 
 
188 aa  276  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  68.62 
 
 
188 aa  276  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  67.02 
 
 
189 aa  276  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  70.9 
 
 
191 aa  274  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  67.55 
 
 
188 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  69.52 
 
 
188 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  65.96 
 
 
189 aa  271  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  65.05 
 
 
189 aa  265  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  65.43 
 
 
188 aa  262  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  62.77 
 
 
188 aa  261  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  63.98 
 
 
191 aa  261  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  61.7 
 
 
188 aa  257  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  61.7 
 
 
188 aa  257  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  257  9e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  255  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  60.64 
 
 
188 aa  255  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  62.23 
 
 
188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  62.23 
 
 
188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  62.23 
 
 
188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  61.7 
 
 
188 aa  251  6e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  62.63 
 
 
191 aa  249  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  61.17 
 
 
187 aa  244  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  56.61 
 
 
189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  59.57 
 
 
188 aa  230  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  61.54 
 
 
183 aa  228  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  52.43 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  54.26 
 
 
190 aa  209  1e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  51.89 
 
 
188 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  53.85 
 
 
185 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  48.37 
 
 
190 aa  205  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  54.1 
 
 
185 aa  204  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  51.91 
 
 
185 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  52.15 
 
 
187 aa  201  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  51.89 
 
 
187 aa  199  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  50.81 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  50 
 
 
187 aa  198  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  53.85 
 
 
185 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  51.61 
 
 
187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  49.46 
 
 
187 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  49.45 
 
 
185 aa  197  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  50.55 
 
 
185 aa  197  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  49.46 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  50 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  49.73 
 
 
187 aa  194  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  50.27 
 
 
186 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  49.46 
 
 
187 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  51.89 
 
 
187 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  51.37 
 
 
185 aa  193  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  49.73 
 
 
186 aa  192  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  49.46 
 
 
190 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  49.46 
 
 
190 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  52.75 
 
 
185 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  50.82 
 
 
185 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  48.91 
 
 
190 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  50.83 
 
 
188 aa  190  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  48.91 
 
 
190 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  52.75 
 
 
187 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  48.11 
 
 
187 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  49.73 
 
 
186 aa  187  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  49.47 
 
 
187 aa  187  9e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  47.85 
 
 
189 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  47.85 
 
 
189 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  47.85 
 
 
189 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  49.46 
 
 
188 aa  185  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  52.46 
 
 
186 aa  185  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  49.45 
 
 
185 aa  184  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  48.09 
 
 
186 aa  184  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  46.77 
 
 
189 aa  184  8e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  50 
 
 
185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  48.09 
 
 
185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>