More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0033 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  93.55 
 
 
186 aa  364  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  90.86 
 
 
186 aa  352  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  89.73 
 
 
187 aa  351  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  88.71 
 
 
186 aa  348  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  88.65 
 
 
187 aa  347  5e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  81.72 
 
 
186 aa  317  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  81.62 
 
 
185 aa  315  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  81.18 
 
 
186 aa  313  8e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  80.11 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  79.57 
 
 
186 aa  309  1e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  77.3 
 
 
185 aa  301  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  75.68 
 
 
185 aa  300  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  76.22 
 
 
185 aa  298  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  76.22 
 
 
185 aa  298  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  74.59 
 
 
185 aa  293  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  74.05 
 
 
185 aa  290  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  69.19 
 
 
185 aa  283  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  54.89 
 
 
185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  54.89 
 
 
185 aa  221  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  53.8 
 
 
185 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  54.35 
 
 
185 aa  214  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  53.8 
 
 
185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  55.43 
 
 
211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  53.76 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  54.35 
 
 
185 aa  210  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  53.8 
 
 
185 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  51.09 
 
 
186 aa  209  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  54.01 
 
 
188 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  208  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  53.76 
 
 
187 aa  208  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  53.8 
 
 
185 aa  208  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  53.8 
 
 
185 aa  208  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  53.26 
 
 
185 aa  207  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  50 
 
 
185 aa  207  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  54.35 
 
 
187 aa  206  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  50 
 
 
185 aa  204  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  53.26 
 
 
185 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  51.09 
 
 
185 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  51.09 
 
 
185 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  51.61 
 
 
187 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  202  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  201  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  52.72 
 
 
185 aa  201  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  201  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  50 
 
 
185 aa  200  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  50.54 
 
 
186 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  51.61 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  50.81 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  51.08 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  51.08 
 
 
186 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  50.54 
 
 
185 aa  197  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  49.73 
 
 
187 aa  197  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  51.34 
 
 
187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  49.46 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  50 
 
 
187 aa  195  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  47.31 
 
 
187 aa  194  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  49.73 
 
 
216 aa  194  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  50.54 
 
 
187 aa  194  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  47.85 
 
 
187 aa  194  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  49.73 
 
 
187 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  51.89 
 
 
186 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  50.81 
 
 
186 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  50.54 
 
 
185 aa  193  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  47.83 
 
 
185 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  50.81 
 
 
185 aa  192  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  50.54 
 
 
187 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  47.28 
 
 
187 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  47.83 
 
 
199 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  50.27 
 
 
185 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  48.92 
 
 
187 aa  191  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  48.13 
 
 
187 aa  191  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  47.59 
 
 
187 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  48.11 
 
 
185 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  47.28 
 
 
185 aa  190  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  47.59 
 
 
187 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  50.54 
 
 
187 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  47.59 
 
 
187 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  48.91 
 
 
187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  47.03 
 
 
186 aa  187  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  46.49 
 
 
188 aa  187  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  47.06 
 
 
187 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  47.25 
 
 
204 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  46.77 
 
 
189 aa  185  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  49.46 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  47.28 
 
 
185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  44.09 
 
 
190 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  44.09 
 
 
190 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  46.2 
 
 
186 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  46.2 
 
 
185 aa  180  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>