More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1034 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  100 
 
 
185 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  64.32 
 
 
185 aa  248  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  61.08 
 
 
185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  61.08 
 
 
185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  58.38 
 
 
185 aa  230  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  58.38 
 
 
185 aa  224  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  57.3 
 
 
186 aa  221  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  55.98 
 
 
185 aa  220  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  55.98 
 
 
185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  52.72 
 
 
185 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  52.43 
 
 
185 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  51.35 
 
 
186 aa  207  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  207  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  207  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  207  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  207  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  206  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  206  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  206  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  54.59 
 
 
185 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  50.27 
 
 
188 aa  202  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  201  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  49.46 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  49.19 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  51.09 
 
 
185 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  194  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  50.54 
 
 
185 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  51.61 
 
 
187 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  47.03 
 
 
186 aa  193  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  49.2 
 
 
188 aa  187  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  48.37 
 
 
189 aa  187  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  47.54 
 
 
204 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  50.54 
 
 
189 aa  184  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  47.83 
 
 
216 aa  184  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  50.27 
 
 
186 aa  184  9e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  46.2 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  47.57 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  45.36 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  46.2 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  49.46 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  43.72 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  46.2 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  46.49 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  46.74 
 
 
186 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  44.32 
 
 
190 aa  180  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  47.03 
 
 
187 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  47.03 
 
 
187 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  47.03 
 
 
187 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  44.81 
 
 
189 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  46.45 
 
 
211 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  47.03 
 
 
187 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  47.03 
 
 
187 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  45.41 
 
 
191 aa  179  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  45.36 
 
 
189 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  45.65 
 
 
190 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  43.72 
 
 
189 aa  178  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  46.45 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  46.45 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  43.78 
 
 
190 aa  178  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  44.26 
 
 
189 aa  177  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  43.41 
 
 
188 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  44.32 
 
 
187 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  45.65 
 
 
185 aa  177  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  45.95 
 
 
185 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  47.59 
 
 
190 aa  177  9e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  44.86 
 
 
187 aa  176  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  48.37 
 
 
187 aa  176  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  44.32 
 
 
188 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  45.95 
 
 
186 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  45.65 
 
 
185 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  47.83 
 
 
185 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  44.57 
 
 
185 aa  175  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  42.62 
 
 
188 aa  175  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  47.8 
 
 
189 aa  174  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  42.08 
 
 
188 aa  174  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  44.86 
 
 
187 aa  174  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  45.95 
 
 
187 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  45.65 
 
 
185 aa  174  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  43.48 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  42.08 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  42.39 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  44.26 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  45.95 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  43.78 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  44.86 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  43.78 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  44.02 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  46.49 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  42.62 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  43.48 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  45.9 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  44.57 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>