More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1458 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  60 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  59.46 
 
 		 185 aa  221  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  57.07 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  55.14 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  52.97 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  54.89 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  52.43 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  56.76 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  52.15 
 
 		 187 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  54.35 
 
 		 186 aa  208  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  53.8 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  52.72 
 
 		 216 aa  207  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  52.43 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  53.8 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  52.72 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  52.43 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  48.37 
 
 		 187 aa  204  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  51.35 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  51.09 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  51.35 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  52.97 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  48.65 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  51.35 
 
 		 187 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  48.65 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  51.63 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  49.46 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  50 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  55.61 
 
 		 192 aa  195  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 190 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  48.65 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 190 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  52.72 
 
 		 189 aa  194  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  51.37 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  47.03 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  48.91 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  48.11 
 
 		 187 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  48.11 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  48.09 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  47.57 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  48.09 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  47.03 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  49.19 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  48.65 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  47.54 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  47.54 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  47.28 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  48.63 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  47.28 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  45.65 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  46.49 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  47.28 
 
 		 187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  50.86 
 
 		 187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  47.83 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  48.09 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  46.77 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  45.36 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  48.92 
 
 		 191 aa  182  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  45.65 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>