More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2901 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  75.27 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  72.87 
 
 		 188 aa  292  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4150  translation elongation factor P  59.36 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  55.08 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  56.15 
 
 		 190 aa  214  8e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  51.6 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  50.53 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 192 aa  201  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1658  translation elongation factor P  50 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  48.92 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  48.15 
 
 		 187 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  51.34 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  48.13 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  49.2 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  47.37 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  48.91 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  48.39 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  45.5 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  45.99 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  49.2 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  48.13 
 
 		 187 aa  184  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  48.92 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  43.92 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  46.77 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  47.87 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  45.5 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  46.77 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  45.74 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  47.28 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  45.5 
 
 		 187 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  48.11 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  46.03 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  48.39 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  47.06 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  47.06 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  47.06 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  47.06 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  47.31 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  48.92 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  46.52 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  46.03 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  44.68 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  47.06 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  48.39 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  48.39 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  46.81 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  48.39 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  47.06 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  44.92 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  44.68 
 
 		 216 aa  174  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  47.06 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  42.86 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  43.85 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  44.15 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  44.62 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  46.52 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  45.83 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  48.39 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  44.39 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  48.39 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  48.13 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  48.13 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  48.13 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  47.85 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  46.24 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  44.39 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  46.24 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  45.7 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  43.32 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  44.39 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  45.99 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  43.01 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  43.85 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  45.7 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  46.52 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  46.52 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  47.31 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  47.31 
 
 		 185 aa  167  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  43.55 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  44.62 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  42.78 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  45.16 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  45.74 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  45.16 
 
 		 185 aa  165  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  44.39 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  44.62 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  42.7 
 
 		 186 aa  164  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  43.92 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>