More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5247 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4150  translation elongation factor P  77.54 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  59.36 
 
 		 190 aa  240  7.999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  55.61 
 
 		 188 aa  224  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  55.08 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  55.08 
 
 		 188 aa  221  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  54.84 
 
 		 188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  52.94 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1658  translation elongation factor P  50.8 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  51.61 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  50.27 
 
 		 199 aa  190  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  48.66 
 
 		 211 aa  186  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  49.2 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  47.31 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  48.65 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  49.2 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  49.73 
 
 		 187 aa  184  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  48.92 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  47.85 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  49.73 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  48.13 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  48.39 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  47.59 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  47.85 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  47.31 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  46.28 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  49.2 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  47.87 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  47.06 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  47.06 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  46.81 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  47.06 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  46.24 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  45.45 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  47.59 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  46.24 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  47.06 
 
 		 187 aa  174  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  47.59 
 
 		 185 aa  171  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  47.06 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  47.34 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  45.99 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  45.21 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  47.59 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  44.92 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  44.39 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  45.16 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  46.52 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  44.92 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  46.52 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  45.16 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  46.52 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  44.39 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  44.39 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  44.02 
 
 		 187 aa  161  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  46.81 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  46.52 
 
 		 185 aa  161  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  44.62 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  43.55 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  43.24 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  44.32 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  43.09 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  42.93 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  44.09 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  41.4 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  41.94 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  41.4 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  41.94 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  42.78 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  41.49 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  40.32 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  42.55 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  42.02 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  40.74 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>