More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3411 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  95.72 
 
 		 187 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  62.9 
 
 		 189 aa  251  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  46.24 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  46.77 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  47.85 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  46.52 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0323  elongation factor P  43.85 
 
 		 233 aa  175  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0872973  normal  0.0117476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  49.73 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  44.09 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  43.85 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2675  elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241431  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0292  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  0.0255427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0200  elongation factor P  45.45 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  47.31 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  47.59 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  46.24 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  45.16 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  43.85 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0237  elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0361  elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1958  elongation factor P  42.78 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000139514  normal  0.25468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  46.81 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  43.85 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  39.89 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  43.92 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  43.62 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  42.16 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  43.32 
 
 		 186 aa  158  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  42.16 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  42.55 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1658  translation elongation factor P  44.68 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  43.09 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  41.62 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  39.67 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  43.09 
 
 		 188 aa  155  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  41.18 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  40.86 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  43.09 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  40.32 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  41.18 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  39.89 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  39.46 
 
 		 189 aa  151  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  44.44 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  41.94 
 
 		 186 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  40.44 
 
 		 190 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4150  translation elongation factor P  42.02 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  40.11 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  41.08 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  41.18 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  37.84 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  36.76 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>