More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1518 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  95.72 
 
 		 187 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  61.83 
 
 		 189 aa  249  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  46.77 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  46.24 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  46.24 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  43.85 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0323  elongation factor P  42.78 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0872973  normal  0.0117476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  47.31 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  45.99 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  48.11 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  42.39 
 
 		 186 aa  168  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0292  elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  0.0255427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0200  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324451  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  167  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  42.78 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  44.09 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2675  elongation factor P  42.25 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  46.81 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  45.45 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  42.78 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  43.92 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0237  elongation factor P  41.71 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0361  elongation factor P  42.25 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  43.09 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1958  elongation factor P  41.18 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000139514  normal  0.25468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  38.3 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  44.32 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  42.02 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  38.59 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  42.02 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  42.25 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  40.64 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  40.88 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  40 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1658  translation elongation factor P  42.55 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  39.78 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  41.49 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  38.71 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  40.11 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  38.83 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  40.86 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 216 aa  148  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  39.89 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  41.08 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  41.49 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  37.3 
 
 		 189 aa  147  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  39.04 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  40.54 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  36.22 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  40.54 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  38.71 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  38.8 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>