More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0468 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  62.03 
 
 		 187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  61.41 
 
 		 186 aa  250  9.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  58.7 
 
 		 186 aa  240  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  48.37 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  50.27 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  49.73 
 
 		 189 aa  194  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  49.2 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  48.35 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  46.74 
 
 		 186 aa  190  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  47.87 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  48.37 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  46.74 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  48.13 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  47.8 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  48.35 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  47.54 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  47.54 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  45.99 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  47.54 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  47.54 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  47.54 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  45.11 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  48.39 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  48.13 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  48.13 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  47.06 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  48.09 
 
 		 187 aa  184  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  49.18 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  48.39 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  47.85 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  47.8 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  46.99 
 
 		 187 aa  184  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  45.36 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  47.85 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  49.2 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  45.99 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  45.45 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  47.31 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  45.99 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  42.86 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  48.09 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  45.36 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  49.2 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  47.85 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  46.52 
 
 		 189 aa  178  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  45.36 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  45.6 
 
 		 187 aa  177  4.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  46.77 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  46.03 
 
 		 190 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  46.77 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  44.81 
 
 		 189 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  46.03 
 
 		 190 aa  177  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  45.45 
 
 		 188 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  46.99 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  47.06 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  45.45 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  42.25 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  45.36 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  46.52 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  46.52 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  47.8 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  46.77 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  46.77 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>