More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2333 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  78.07 
 
 		 187 aa  310  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  79.14 
 
 		 187 aa  308  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  77.54 
 
 		 187 aa  308  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  76.47 
 
 		 187 aa  303  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  75.94 
 
 		 187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  75.94 
 
 		 187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  75.94 
 
 		 187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  75.4 
 
 		 187 aa  295  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  74.19 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  72.58 
 
 		 186 aa  286  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  71.74 
 
 		 185 aa  279  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  68.98 
 
 		 187 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  69.89 
 
 		 186 aa  277  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  69.35 
 
 		 187 aa  275  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  67.91 
 
 		 187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  67.38 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  70.27 
 
 		 187 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  67.91 
 
 		 187 aa  270  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  68.82 
 
 		 187 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  66.67 
 
 		 187 aa  269  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  69.35 
 
 		 187 aa  268  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  66.49 
 
 		 187 aa  267  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  66.49 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  67.03 
 
 		 186 aa  263  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  65.78 
 
 		 187 aa  263  8.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  66.13 
 
 		 187 aa  262  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  68.48 
 
 		 185 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  63.44 
 
 		 199 aa  260  8.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  66.31 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  65.05 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  64.67 
 
 		 185 aa  254  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  65.22 
 
 		 185 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  64.13 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  64.13 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  64.71 
 
 		 187 aa  247  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  63.59 
 
 		 187 aa  244  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  61.62 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  52.43 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  51.89 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  51.61 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  51.63 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  51.35 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  50.27 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  49.46 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  48.92 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  53.51 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  50.81 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  50.54 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  52.91 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  48.39 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  52.41 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  50.27 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  49.19 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  52.38 
 
 		 188 aa  197  7.999999999999999e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  52.17 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  51.09 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  49.46 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  47.85 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  48.92 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  49.73 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  50.27 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  46.6 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  47.8 
 
 		 190 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  47.8 
 
 		 190 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  49.19 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  52.91 
 
 		 192 aa  187  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  47.25 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  50.54 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  49.2 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>