More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1005 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  71.2 
 
 
185 aa  284  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  67.57 
 
 
185 aa  269  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  64.32 
 
 
185 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  63.78 
 
 
185 aa  256  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  63.04 
 
 
185 aa  254  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  62.16 
 
 
185 aa  245  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  60.54 
 
 
185 aa  240  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  60 
 
 
185 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  57.07 
 
 
185 aa  238  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  63.04 
 
 
186 aa  237  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  58.92 
 
 
185 aa  236  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  56.52 
 
 
185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  55.98 
 
 
185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  53.8 
 
 
188 aa  227  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  56.22 
 
 
185 aa  226  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  54.59 
 
 
189 aa  225  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  57.61 
 
 
185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  224  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  224  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  54.89 
 
 
185 aa  223  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  223  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  223  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  223  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  57.3 
 
 
186 aa  223  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  55.68 
 
 
185 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  55.98 
 
 
185 aa  223  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  55.14 
 
 
185 aa  222  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  57.07 
 
 
185 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  57.07 
 
 
185 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  53.8 
 
 
185 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  52.17 
 
 
186 aa  218  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  54.89 
 
 
185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  54.89 
 
 
185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  53.8 
 
 
185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  52.72 
 
 
186 aa  217  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  52.72 
 
 
186 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  54.35 
 
 
185 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  52.43 
 
 
186 aa  214  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  51.63 
 
 
186 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  52.72 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  52.72 
 
 
186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  53.8 
 
 
187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  53.26 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  53.26 
 
 
187 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  53.26 
 
 
187 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  52.17 
 
 
185 aa  208  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  51.09 
 
 
185 aa  207  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  48.63 
 
 
190 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  48.63 
 
 
190 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  48.09 
 
 
190 aa  204  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  50 
 
 
185 aa  204  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  50 
 
 
185 aa  204  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  47.54 
 
 
190 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  51.09 
 
 
189 aa  202  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  50.27 
 
 
185 aa  202  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  50.82 
 
 
186 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  51.89 
 
 
187 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  47.57 
 
 
185 aa  201  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  53.01 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  53.01 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  50.55 
 
 
189 aa  197  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  51.63 
 
 
185 aa  197  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  50.81 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  44.81 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  48.37 
 
 
187 aa  194  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  48.65 
 
 
187 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  46.99 
 
 
188 aa  193  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  51.09 
 
 
188 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  47.54 
 
 
189 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  47.54 
 
 
189 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  47.83 
 
 
187 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  49.19 
 
 
185 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  47.54 
 
 
189 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  47.83 
 
 
187 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  49.73 
 
 
186 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  48.63 
 
 
189 aa  191  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  48.39 
 
 
186 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  48.09 
 
 
188 aa  191  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  48.65 
 
 
190 aa  191  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  50.27 
 
 
189 aa  190  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  47.54 
 
 
187 aa  190  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  48.63 
 
 
186 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  48.65 
 
 
190 aa  189  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  46.2 
 
 
187 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  48.09 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  46.99 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  48.37 
 
 
188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  47.83 
 
 
187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  46.11 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  46.99 
 
 
187 aa  188  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  44.57 
 
 
187 aa  187  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  46.15 
 
 
204 aa  187  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  45.65 
 
 
187 aa  187  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  48.91 
 
 
187 aa  187  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  47.57 
 
 
185 aa  187  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>