More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1082 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  74.47 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  73.02 
 
 		 191 aa  296  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  71.66 
 
 		 188 aa  290  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  71.28 
 
 		 188 aa  290  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  68.42 
 
 		 190 aa  285  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  69.35 
 
 		 188 aa  283  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  67.37 
 
 		 190 aa  283  9e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  67.2 
 
 		 189 aa  281  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  67.02 
 
 		 191 aa  280  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  70.59 
 
 		 187 aa  280  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  66.67 
 
 		 189 aa  277  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  67.2 
 
 		 187 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  67.2 
 
 		 189 aa  275  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  66.31 
 
 		 188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  67.2 
 
 		 188 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  67.2 
 
 		 188 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  67.2 
 
 		 188 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  67.2 
 
 		 188 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  67.2 
 
 		 188 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  63.49 
 
 		 189 aa  268  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  64.02 
 
 		 189 aa  267  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  64.71 
 
 		 188 aa  267  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  66.67 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  65.59 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  64.71 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  63.1 
 
 		 188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  63.1 
 
 		 188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  65.24 
 
 		 188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  65.05 
 
 		 189 aa  265  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  64.17 
 
 		 188 aa  264  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  62.43 
 
 		 191 aa  262  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  65.05 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  65.05 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  65.05 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  65.05 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  62.43 
 
 		 189 aa  261  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  65.05 
 
 		 188 aa  260  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  64.52 
 
 		 188 aa  259  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  64.52 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  62.57 
 
 		 188 aa  255  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  62.9 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  57.22 
 
 		 188 aa  243  8e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  57.22 
 
 		 187 aa  240  9e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  55.32 
 
 		 189 aa  232  3e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  55.38 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  54.7 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  52.46 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  47.31 
 
 		 190 aa  198  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  49.18 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  48.09 
 
 		 187 aa  194  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  48.09 
 
 		 185 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  48.09 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  45.7 
 
 		 190 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  45.36 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  45.7 
 
 		 190 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  46.03 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  45.16 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  44.92 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  45.9 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  47.25 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  48.63 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  44.62 
 
 		 190 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  48.37 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  48.65 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  46.2 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  46.7 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  47.09 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  45.9 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  45.36 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  46.77 
 
 		 187 aa  180  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  47.54 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  45.99 
 
 		 188 aa  179  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  45.5 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  45.5 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  45.5 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  47.83 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  44.57 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  44.57 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  42.25 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  44.26 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  48.65 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>