More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0132 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  88.77 
 
 
189 aa  356  9.999999999999999e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  88.77 
 
 
189 aa  353  7.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  88.77 
 
 
189 aa  353  7.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  88.77 
 
 
189 aa  353  7.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  85.03 
 
 
189 aa  347  4e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  85.11 
 
 
187 aa  339  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  86.1 
 
 
188 aa  339  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  73.91 
 
 
187 aa  291  5e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  58.01 
 
 
188 aa  228  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  51.37 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  48.88 
 
 
190 aa  197  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  51.4 
 
 
188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  49.73 
 
 
189 aa  195  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  46.99 
 
 
185 aa  193  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  48.31 
 
 
190 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  50.55 
 
 
185 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  48.31 
 
 
190 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  47.85 
 
 
187 aa  191  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  47.75 
 
 
190 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  46.15 
 
 
185 aa  191  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  50.54 
 
 
188 aa  191  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  48.91 
 
 
188 aa  189  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  50.83 
 
 
189 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  49.72 
 
 
185 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  48.91 
 
 
186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  46.7 
 
 
185 aa  187  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  48.35 
 
 
186 aa  186  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  48.65 
 
 
189 aa  186  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  44.32 
 
 
190 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  48.37 
 
 
188 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  46.7 
 
 
185 aa  185  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  48.11 
 
 
187 aa  185  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  46.99 
 
 
185 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  47.28 
 
 
189 aa  184  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  45.95 
 
 
189 aa  184  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  46.52 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  44.51 
 
 
185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  46.45 
 
 
185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  47.57 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.69408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  46.28 
 
 
190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  45.3 
 
 
187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  47.57 
 
 
188 aa  181  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  47.57 
 
 
188 aa  181  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  46.49 
 
 
187 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  44.81 
 
 
185 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  46.11 
 
 
187 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  45.99 
 
 
189 aa  179  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  45.86 
 
 
186 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  45.95 
 
 
216 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  46.2 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  46.99 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  178  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  178  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  45.6 
 
 
185 aa  178  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  47.78 
 
 
185 aa  178  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  178  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  46.2 
 
 
204 aa  177  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  43.33 
 
 
187 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  45.11 
 
 
188 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  45.56 
 
 
187 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  46.96 
 
 
187 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  46.96 
 
 
187 aa  175  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  46.45 
 
 
185 aa  175  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  45.65 
 
 
188 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  43.17 
 
 
185 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  45.11 
 
 
187 aa  174  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  43.17 
 
 
185 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  44.09 
 
 
188 aa  174  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  45.95 
 
 
186 aa  174  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  43.72 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  43.24 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  44.57 
 
 
187 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  44.2 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  46.15 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  43.72 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  43.72 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  45.7 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  43.72 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  45.11 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  45.11 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  43.72 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  44.57 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  44.32 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>