More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1054 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  62.9 
 
 
187 aa  251  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  61.83 
 
 
187 aa  249  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  50.27 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  51.89 
 
 
186 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  48.92 
 
 
188 aa  194  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  51.89 
 
 
185 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  51.63 
 
 
185 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  48.11 
 
 
185 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  53.51 
 
 
185 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  52.72 
 
 
192 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  191  4e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  190  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  49.19 
 
 
185 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  51.09 
 
 
187 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  48.39 
 
 
186 aa  188  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  50.82 
 
 
185 aa  187  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  49.46 
 
 
188 aa  187  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  50.27 
 
 
185 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  47.28 
 
 
185 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  48.39 
 
 
188 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  50.27 
 
 
185 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  49.73 
 
 
185 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  49.46 
 
 
185 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  49.73 
 
 
185 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  49.73 
 
 
185 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  49.73 
 
 
185 aa  184  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  49.73 
 
 
185 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  50.54 
 
 
185 aa  184  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  49.73 
 
 
185 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  49.73 
 
 
185 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  48.92 
 
 
187 aa  184  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  48.39 
 
 
187 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  46.49 
 
 
188 aa  184  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  49.19 
 
 
185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  46.45 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  46.49 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  47.03 
 
 
186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  48.91 
 
 
190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  42.86 
 
 
187 aa  180  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4150  translation elongation factor P  48.39 
 
 
188 aa  179  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  50.26 
 
 
185 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  47.28 
 
 
185 aa  178  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  47.62 
 
 
189 aa  178  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  45.7 
 
 
216 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  48.91 
 
 
185 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  47.83 
 
 
190 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  47.83 
 
 
190 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  47.83 
 
 
190 aa  177  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  45.41 
 
 
185 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  46.24 
 
 
185 aa  175  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  47.03 
 
 
185 aa  175  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  49.73 
 
 
189 aa  174  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  46.45 
 
 
186 aa  174  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  44.86 
 
 
185 aa  174  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  47.57 
 
 
186 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  46.77 
 
 
187 aa  174  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  47.57 
 
 
185 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  47.57 
 
 
185 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  44.86 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  46.74 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  47.03 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  49.19 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  45.41 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  44.86 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  44.32 
 
 
187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  45.65 
 
 
187 aa  171  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  44.86 
 
 
187 aa  171  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  44.62 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  44.62 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  44.74 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  44.62 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  46.49 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  44.86 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  44.32 
 
 
188 aa  170  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  45.95 
 
 
185 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  46.24 
 
 
187 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  45.95 
 
 
185 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  45.41 
 
 
211 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  47.57 
 
 
187 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  44.62 
 
 
187 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  45.65 
 
 
185 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  45.95 
 
 
187 aa  168  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  45.11 
 
 
185 aa  168  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  44.32 
 
 
187 aa  168  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  47.19 
 
 
187 aa  168  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0292  elongation factor P  44.32 
 
 
188 aa  167  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  0.0255427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  44.32 
 
 
186 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0200  elongation factor P  43.78 
 
 
188 aa  166  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  46.45 
 
 
186 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  44.32 
 
 
199 aa  165  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2675  elongation factor P  43.17 
 
 
188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241431  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0323  elongation factor P  43.24 
 
 
233 aa  164  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0872973  normal  0.0117476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  41.62 
 
 
187 aa  164  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  44.86 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  45.11 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  42.39 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  44.02 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  44.02 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  43.24 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0283739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>