More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2675 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2675  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0237  elongation factor P  85.64 
 
 		 188 aa  337  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0200  elongation factor P  84.04 
 
 		 188 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324451  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0361  elongation factor P  83.51 
 
 		 188 aa  333  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1958  elongation factor P  82.98 
 
 		 212 aa  330  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000139514  normal  0.25468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0323  elongation factor P  77.13 
 
 		 233 aa  310  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0872973  normal  0.0117476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0292  elongation factor P  77.13 
 
 		 188 aa  305  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  0.0255427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  49.73 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  43.85 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  43.17 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  42.25 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  38.38 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  37.91 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2499  translation elongation factor P (EF-P)  42.25 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  37.77 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  40 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  35.48 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  36.02 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  38.38 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  37.43 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  41.18 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  37.84 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  36.56 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  36.76 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  39.25 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  41.18 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  40.32 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  36.56 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  37.3 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  37.43 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  37.1 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  38.38 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  35.87 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  40.76 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  39.67 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  38.92 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  37.3 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  37.84 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  37.1 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  40.22 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  36.7 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  37.1 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  35.68 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  37.23 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  37.23 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  39.46 
 
 		 188 aa  141  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  40 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  37.1 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  41.01 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  37.43 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  37.1 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  38.92 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  39.46 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  37.3 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  37.3 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  39.15 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  36.22 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  39.15 
 
 		 188 aa  137  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  37.3 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  37.3 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  37.77 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  35.11 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  38.38 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  38.92 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  36.17 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  38.38 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  36.7 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  38.38 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  35.29 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>