More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07870 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  63.59 
 
 		 186 aa  261  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  64.86 
 
 		 186 aa  256  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  62.03 
 
 		 187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  44.92 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  47.28 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  46.74 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  45.36 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  46.52 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  44.92 
 
 		 188 aa  180  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  45.99 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  47.85 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  44.92 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  44.92 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  48.66 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  177  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  44.62 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  44.09 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  44.92 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  44.92 
 
 		 188 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  47.59 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  46.81 
 
 		 191 aa  175  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  45.9 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  43.72 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  48.39 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  47.54 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  47.54 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  45.6 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  44.92 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  45.36 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  48.63 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  46.24 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  42.33 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  42.33 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  44.51 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  48.09 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  42.25 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  44.74 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  44.26 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 191 aa  170  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  44.02 
 
 		 188 aa  170  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  170  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  43.92 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  43.85 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  44.81 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  43.72 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  43.72 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  43.72 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  44.92 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  43.17 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  42.93 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  44.26 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  43.17 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  43.96 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  42.78 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  42.78 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  43.09 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  43.72 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  44.92 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  43.85 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  43.85 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  42.08 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  43.85 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>