More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03678 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  86.77 
 
 		 189 aa  349  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  83.07 
 
 		 191 aa  336  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  82.98 
 
 		 188 aa  331  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  81.91 
 
 		 188 aa  327  7e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  81.38 
 
 		 188 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  81.38 
 
 		 188 aa  325  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  76.72 
 
 		 189 aa  320  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  76.6 
 
 		 188 aa  312  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  300  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  72.49 
 
 		 190 aa  296  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  72.49 
 
 		 190 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  72.34 
 
 		 188 aa  291  5e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  70.21 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  70.21 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  70.21 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  68.62 
 
 		 189 aa  284  5.999999999999999e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  68.59 
 
 		 191 aa  283  9e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  69.31 
 
 		 191 aa  283  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  68.62 
 
 		 188 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  70.05 
 
 		 187 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  68.09 
 
 		 188 aa  280  7.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  68.62 
 
 		 188 aa  279  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  63.49 
 
 		 189 aa  279  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  68.45 
 
 		 188 aa  278  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  68.62 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  68.62 
 
 		 188 aa  278  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  66.67 
 
 		 189 aa  277  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  67.2 
 
 		 189 aa  275  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  67.2 
 
 		 189 aa  273  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  71.12 
 
 		 187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  62.77 
 
 		 188 aa  267  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  62.77 
 
 		 188 aa  267  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  65.43 
 
 		 189 aa  267  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  64.17 
 
 		 191 aa  260  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  62.77 
 
 		 188 aa  254  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  59.26 
 
 		 189 aa  250  7e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  62.77 
 
 		 187 aa  250  7e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  58.51 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  60.44 
 
 		 183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  51.09 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  50.79 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  51.05 
 
 		 190 aa  201  6e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  49.73 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  50.79 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  50.79 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  50.79 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  50.79 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  48.68 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  45.16 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  42.93 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  48.09 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  46.74 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  50 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  48.94 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  49.18 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  46.15 
 
 		 190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  47.8 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  46.99 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  47.83 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  46.7 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  46.99 
 
 		 186 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  46.15 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  46.52 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  47.54 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  44.92 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  45.05 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  45.05 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  46.24 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  44.51 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 216 aa  174  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  45.36 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  43.65 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  46.67 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  48.35 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>