More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2234 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  91.49 
 
 		 188 aa  363  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  89.89 
 
 		 188 aa  359  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  81.91 
 
 		 188 aa  329  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  79.79 
 
 		 188 aa  328  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  81.38 
 
 		 189 aa  325  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  76.06 
 
 		 189 aa  314  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  75 
 
 		 189 aa  310  6.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  299  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  298  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  73.12 
 
 		 191 aa  294  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  70.21 
 
 		 188 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  70.21 
 
 		 188 aa  286  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  70.21 
 
 		 188 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  70.74 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  281  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  69.68 
 
 		 188 aa  280  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  67.72 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  67.72 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  68.09 
 
 		 188 aa  278  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  68.09 
 
 		 188 aa  278  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  67.55 
 
 		 188 aa  275  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  67.55 
 
 		 189 aa  273  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  67.2 
 
 		 191 aa  272  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  63.83 
 
 		 189 aa  271  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  65.96 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  66.14 
 
 		 191 aa  265  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  64.17 
 
 		 189 aa  264  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  65.43 
 
 		 189 aa  263  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  63.83 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  63.83 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  65.24 
 
 		 188 aa  261  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  63.64 
 
 		 187 aa  258  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  63.83 
 
 		 189 aa  258  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  62.96 
 
 		 189 aa  257  7e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  62.57 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  64.71 
 
 		 187 aa  251  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  62.77 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  62.77 
 
 		 187 aa  244  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  62.64 
 
 		 183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  50.81 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  43.55 
 
 		 190 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  49.47 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  48.39 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  48.94 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  46.52 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  45.41 
 
 		 190 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 190 aa  180  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 190 aa  180  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  46.15 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  48.39 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  48.39 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  48.39 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  48.39 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  46.2 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  45.41 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  46.2 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  43.24 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  46.28 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  46.24 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  43.62 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  43.78 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  45.86 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  47.25 
 
 		 187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  44.75 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  43.65 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  48.09 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  43.65 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  44.57 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  43.65 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  44.68 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  47.59 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  45.11 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  45.6 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  45.21 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>