More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1658 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1658  translation elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  53.72 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  53.19 
 
 		 188 aa  207  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  50.8 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  50 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  50.8 
 
 		 190 aa  198  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  47.31 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4150  translation elongation factor P  49.2 
 
 		 188 aa  191  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  47.87 
 
 		 188 aa  191  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  43.55 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  41.8 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  44.68 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  43.62 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  44.62 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  39.89 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  38.1 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  43.32 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  40.86 
 
 		 189 aa  150  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  37.1 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  41.71 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  42.55 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  40.86 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  37.04 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  38.5 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  39.68 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  38.5 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  39.04 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  38.1 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 186 aa  147  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  39.15 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  40.96 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  38.1 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  39.57 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  38.83 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  37.97 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  37.97 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  37.97 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  37.97 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  37.97 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  38.59 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  41.49 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  39.25 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  42.78 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  42.78 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  39.15 
 
 		 187 aa  141  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  37.97 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  39.29 
 
 		 190 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  40.43 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  36.17 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  41.4 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  41.94 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  39.36 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  38.83 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  40.86 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  41.71 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  38.04 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  38.78 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  38.5 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  38.78 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  37.97 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  40.32 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  41.4 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>