More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1752 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  90.37 
 
 		 187 aa  360  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  82.89 
 
 		 187 aa  334  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  80.75 
 
 		 187 aa  329  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  79.14 
 
 		 187 aa  322  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  78.61 
 
 		 187 aa  321  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  78.07 
 
 		 187 aa  313  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  63.98 
 
 		 187 aa  268  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  57.61 
 
 		 190 aa  235  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  53.23 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  51.61 
 
 		 189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  48.62 
 
 		 190 aa  197  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  49.17 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  49.17 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  48.62 
 
 		 190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  48.65 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  47.28 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  47.57 
 
 		 189 aa  187  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  47.57 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  47.03 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  45.36 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  45.36 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  45.36 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  47.03 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  44.86 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  46.49 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  46.49 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  46.49 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  46.49 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  46.49 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  46.49 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  47.31 
 
 		 188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  45.95 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  44.57 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  44.75 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  46.77 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  45.41 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  44.39 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  44.62 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  44.26 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  44.86 
 
 		 188 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  45.7 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  45.95 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  43.33 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  47.34 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  47.34 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  46.28 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  44.57 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  44.92 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  45.16 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  44.26 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  44.26 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  43.78 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  43.78 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  43.78 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  43.78 
 
 		 188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 191 aa  170  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  44.02 
 
 		 187 aa  170  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  42.86 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>