More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2021 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  48.11 
 
 
185 aa  174  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  50 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  50 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  44.92 
 
 
187 aa  171  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  47.03 
 
 
185 aa  169  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  45.11 
 
 
185 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  45.11 
 
 
185 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  45.16 
 
 
187 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  45.41 
 
 
185 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  44.57 
 
 
187 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  44.92 
 
 
187 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  43.55 
 
 
186 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  43.24 
 
 
187 aa  158  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  44.02 
 
 
187 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  43.48 
 
 
185 aa  157  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  43.01 
 
 
186 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  43.55 
 
 
186 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  41.08 
 
 
185 aa  156  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  44.09 
 
 
186 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  42.7 
 
 
185 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  41.85 
 
 
185 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  42.47 
 
 
186 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  42.93 
 
 
185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  41.3 
 
 
190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  42.93 
 
 
185 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  41.94 
 
 
186 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  40.86 
 
 
186 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  43.48 
 
 
185 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  45.41 
 
 
185 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  41.85 
 
 
185 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  42.93 
 
 
185 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  43.48 
 
 
185 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  42.47 
 
 
187 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  44.62 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  43.24 
 
 
187 aa  151  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  43.01 
 
 
186 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  42.93 
 
 
185 aa  151  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  39.57 
 
 
187 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  41.53 
 
 
190 aa  151  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  42.31 
 
 
211 aa  151  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  43.48 
 
 
185 aa  151  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  39.25 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  40.54 
 
 
185 aa  150  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  43.01 
 
 
186 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  40.86 
 
 
187 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  41.85 
 
 
185 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  42.39 
 
 
185 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  40.64 
 
 
187 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  40.56 
 
 
186 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  41.4 
 
 
187 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  43.78 
 
 
185 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  42.16 
 
 
188 aa  148  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  41.44 
 
 
188 aa  148  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  39.25 
 
 
187 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  41.44 
 
 
188 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  41.44 
 
 
188 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  41.44 
 
 
188 aa  147  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  147  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  147  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  147  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  41.62 
 
 
187 aa  147  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  42.78 
 
 
187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  39.01 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  39.78 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  37.84 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  41.08 
 
 
187 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  39.56 
 
 
204 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  39.01 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  40.33 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  40.54 
 
 
187 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  40.32 
 
 
187 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  144  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  38.92 
 
 
185 aa  144  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  40.54 
 
 
187 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  42.16 
 
 
185 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  40 
 
 
187 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  40.64 
 
 
187 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  40.88 
 
 
188 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  35.87 
 
 
185 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  38.71 
 
 
187 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  41.08 
 
 
185 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>