More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2589 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  70.21 
 
 
187 aa  277  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  68.09 
 
 
187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  67.2 
 
 
190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  65.78 
 
 
186 aa  263  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  65.78 
 
 
186 aa  263  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  68.82 
 
 
187 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  65.24 
 
 
211 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  67.2 
 
 
187 aa  255  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  67.2 
 
 
213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  64.71 
 
 
189 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  61.5 
 
 
188 aa  240  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  61.08 
 
 
187 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  60.54 
 
 
187 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  60.54 
 
 
187 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  60.75 
 
 
187 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  54.79 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  54.79 
 
 
187 aa  218  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  55.32 
 
 
187 aa  215  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  49.73 
 
 
188 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  47.59 
 
 
188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  47.59 
 
 
188 aa  194  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  47.06 
 
 
188 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  50.27 
 
 
188 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  47.06 
 
 
188 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  48.13 
 
 
188 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  49.2 
 
 
188 aa  189  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  45.45 
 
 
187 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  45.45 
 
 
216 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  45.99 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  44.92 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  43.85 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  45.99 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  44.39 
 
 
188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  43.32 
 
 
188 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  45.56 
 
 
186 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  48.66 
 
 
186 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  48.66 
 
 
186 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  42.78 
 
 
189 aa  174  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  42.25 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  41.71 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  41.71 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  42.25 
 
 
189 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  42.02 
 
 
189 aa  168  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  41.49 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  40.11 
 
 
188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  40.11 
 
 
188 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  40.11 
 
 
188 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  42.47 
 
 
188 aa  159  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  41.49 
 
 
189 aa  157  6e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  41.85 
 
 
189 aa  157  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  42.86 
 
 
191 aa  157  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  44.62 
 
 
188 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  41.76 
 
 
185 aa  148  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  41.08 
 
 
185 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  39.46 
 
 
185 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  39.46 
 
 
185 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  141  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  141  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  141  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  141  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  141  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  141  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  42.25 
 
 
207 aa  141  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  41.21 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  41.53 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  37.16 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  37.97 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  40.66 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  39.46 
 
 
185 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  36.76 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  37.97 
 
 
186 aa  137  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  39.13 
 
 
187 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  37.84 
 
 
185 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  39.46 
 
 
185 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  40.11 
 
 
185 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  39.13 
 
 
187 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  38.25 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  134  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  38.8 
 
 
186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  39.01 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  38.25 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  39.78 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  37.3 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  39.25 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  36.07 
 
 
211 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  36.26 
 
 
185 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  37.7 
 
 
186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  38.92 
 
 
185 aa  130  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  38.46 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  39.13 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  38.59 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  37.63 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>