More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1077 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  65.78 
 
 		 188 aa  257  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  64.71 
 
 		 188 aa  252  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  51.08 
 
 		 187 aa  217  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  51.61 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  48.39 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  47.85 
 
 		 186 aa  205  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  47.31 
 
 		 211 aa  204  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  47.85 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  51.34 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  50.54 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  46.49 
 
 		 190 aa  201  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  48.11 
 
 		 188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  47.03 
 
 		 187 aa  191  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  45.95 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  45.16 
 
 		 189 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  45.45 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  46.77 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  46.77 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  43.85 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  44.32 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  46.52 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  45.74 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  44.39 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  44.92 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  44.32 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  43.85 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  43.32 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  43.32 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  44.39 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  43.62 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  42.78 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  42.78 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  44.15 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  42.55 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  40.64 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  41.62 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  37.57 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  36.02 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  37.22 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  35.36 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  35.52 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  35.52 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  35.33 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  36.76 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  34.78 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  37.16 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  33.89 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  34.97 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  37.91 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  32.24 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  34.24 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  32.6 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  36.07 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  34.97 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  34.24 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  34.97 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  35.91 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  34.97 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  35.52 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  35.91 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  37.78 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  35.52 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  31.49 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  33.33 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  33.7 
 
 		 186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  33.51 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  34.43 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  34.43 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  34.43 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  34.43 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  34.25 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  34.43 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  35.36 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  34.97 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  33.15 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  33.15 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  33.7 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  33.15 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  33.15 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  34.24 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>