More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3217 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  83.51 
 
 		 189 aa  328  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  70.97 
 
 		 187 aa  288  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  72.43 
 
 		 211 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  71.74 
 
 		 190 aa  285  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  71.35 
 
 		 186 aa  284  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  70.81 
 
 		 186 aa  281  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  70.43 
 
 		 187 aa  276  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  61.5 
 
 		 188 aa  240  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  60.22 
 
 		 187 aa  235  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  58.6 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  58.6 
 
 		 187 aa  227  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  58.6 
 
 		 187 aa  227  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  58.06 
 
 		 187 aa  225  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  57.22 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  57.53 
 
 		 187 aa  224  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  57.22 
 
 		 187 aa  224  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  57.22 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  56.68 
 
 		 187 aa  221  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  52.43 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  48.11 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  50.81 
 
 		 188 aa  194  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  43.24 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  43.24 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  42.7 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  42.16 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  42.25 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  41.62 
 
 		 188 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  42.16 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  43.24 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  41.08 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  43.75 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  42.7 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  41.62 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  44.75 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  41.71 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  40 
 
 		 216 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  40.11 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  40 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  41.08 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  42.62 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  40.64 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  41.08 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  41.08 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  40 
 
 		 188 aa  160  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  41.53 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  38.5 
 
 		 189 aa  157  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  38.71 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  42.62 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  42.16 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  42.08 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  38.17 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  41.53 
 
 		 185 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  40.98 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  41.99 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  39.46 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  37.91 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  41.44 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  38.92 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  41.08 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  40.44 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  40.33 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  39.46 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  38.92 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  40.54 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  37.36 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  40.54 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  39.23 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  39.44 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  41.08 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  37.36 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  38.04 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  38.42 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  40.44 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  40.44 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  39.89 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  39.56 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  38.86 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  34.62 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  35.71 
 
 		 199 aa  138  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  39.89 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  35 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>