More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0977 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  57.3 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  48.92 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  46.77 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  46.77 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  47.31 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  47.57 
 
 		 190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  46.24 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  46.24 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  45.16 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  44.62 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  48.66 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  174  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  46.24 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  43.55 
 
 		 187 aa  170  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  45.45 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  45.16 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  46.11 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  45.65 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  44.44 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  44.32 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  45.56 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  42.16 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  39.78 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  42.47 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  42.93 
 
 		 189 aa  161  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  42.16 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  45.36 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  40.32 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  43.17 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  42.22 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  41.71 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  42.62 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  40.32 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  41.71 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  41.67 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  40.32 
 
 		 188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  41.34 
 
 		 187 aa  154  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  42.08 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  42.62 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  40.98 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  38.71 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  39.67 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  42.93 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  40.78 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  42.22 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  41.53 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  41.53 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  40.98 
 
 		 186 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  41.3 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  40.98 
 
 		 186 aa  150  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  38.55 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  40.44 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  44.2 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  42.93 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  42.93 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  38.55 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  41.53 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  42.16 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  41.53 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  38.71 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  41.08 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  38.71 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  39.11 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  38.17 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  40.11 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  37.63 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  41.34 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  43.01 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  40.22 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  40.44 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>