More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1314 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  81.82 
 
 		 187 aa  326  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  79.68 
 
 		 187 aa  315  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  62.03 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  59.68 
 
 		 186 aa  244  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  60.22 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  59.14 
 
 		 211 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  60.43 
 
 		 187 aa  239  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  56.76 
 
 		 190 aa  235  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  58.06 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  58.06 
 
 		 188 aa  225  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  54.59 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  55.32 
 
 		 188 aa  215  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  52.97 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  53.51 
 
 		 187 aa  211  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  50.54 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  51.09 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  51.09 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  51.63 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  49.73 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  51.61 
 
 		 188 aa  190  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  51.08 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  41.4 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  40.32 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  41.4 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  43.01 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  41.4 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  40.86 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  43.55 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  43.55 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  40.86 
 
 		 188 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  41.34 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  40.32 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  40.32 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  38.71 
 
 		 189 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  41.18 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  41.71 
 
 		 189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  38.71 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  39.78 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  44.13 
 
 		 188 aa  160  8.000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  43.72 
 
 		 189 aa  160  9e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  43.72 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  39.25 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  40.86 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  37.7 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  36.61 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  37.16 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  39.44 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  39.44 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  39.57 
 
 		 191 aa  144  9e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  36.56 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  36.22 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  36.61 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  34.24 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  36.11 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  38.33 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  36.22 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  35.14 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  36.61 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  36.61 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  36.96 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  35.87 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  36.07 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  36.07 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  36.67 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  38.67 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  38.67 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  34.78 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  38.67 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  34.97 
 
 		 185 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  34.59 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  36.11 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  37.5 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  33.15 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  33.52 
 
 		 204 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  35 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  37.22 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  32.6 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  35.36 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  36.87 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  32.62 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>