More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3184 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  86.56 
 
 		 186 aa  344  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  86.02 
 
 		 186 aa  340  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  85.48 
 
 		 211 aa  340  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  84.32 
 
 		 190 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  74.33 
 
 		 187 aa  298  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  72.04 
 
 		 189 aa  291  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  70.97 
 
 		 188 aa  288  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  70.21 
 
 		 188 aa  277  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  65.24 
 
 		 187 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  64.86 
 
 		 213 aa  255  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  63.78 
 
 		 187 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  63.78 
 
 		 187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  62.03 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  61.5 
 
 		 187 aa  248  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  60.33 
 
 		 187 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  60.54 
 
 		 187 aa  235  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  58.15 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  58.15 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  54.84 
 
 		 188 aa  218  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  54.84 
 
 		 188 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  48.39 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  48.39 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  47.85 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  46.77 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  45.7 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  45.7 
 
 		 188 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  48.92 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  48.92 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  46.24 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  44.09 
 
 		 216 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  45.7 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  43.85 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  44.51 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  42.47 
 
 		 189 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  43.32 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  42.47 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  41.4 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  41.4 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  44.32 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  42.78 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  43.78 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  42.47 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  41.4 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  43.17 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  41.18 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  43.17 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  40.44 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  42.62 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  40.44 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  41.53 
 
 		 185 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  41.53 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  39.89 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  39.46 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  39.13 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  38.8 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  39.89 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  39.89 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  40.78 
 
 		 187 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  40.88 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  42.78 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  38.04 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  38.55 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  38.92 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  38.92 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  35.71 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  38.92 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  39.11 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  38.92 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  37.5 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  38.38 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>