More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1206 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  97.85 
 
 
186 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  96.77 
 
 
186 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  85.48 
 
 
187 aa  340  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  83.78 
 
 
190 aa  333  9e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  73.12 
 
 
187 aa  293  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  72.97 
 
 
189 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  72.43 
 
 
188 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  65.05 
 
 
187 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  65.24 
 
 
188 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  62.7 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  59.68 
 
 
187 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  59.57 
 
 
213 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  58.92 
 
 
187 aa  243  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  59.14 
 
 
187 aa  242  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  58.15 
 
 
187 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  58.15 
 
 
187 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  58.15 
 
 
187 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  54.55 
 
 
187 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  53.23 
 
 
188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  53.23 
 
 
188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  47.31 
 
 
187 aa  204  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  47.31 
 
 
188 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  45.7 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  46.24 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  44.09 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  44.62 
 
 
188 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  45.7 
 
 
188 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  43.01 
 
 
188 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  45.99 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  45.7 
 
 
188 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  43.55 
 
 
188 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  44.09 
 
 
188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  43.55 
 
 
188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  43.55 
 
 
188 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  43.55 
 
 
188 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  45.16 
 
 
186 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  45.16 
 
 
186 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  41.4 
 
 
216 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  41.4 
 
 
188 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  44.09 
 
 
188 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  44.69 
 
 
186 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  44.39 
 
 
189 aa  177  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  43.32 
 
 
189 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  42.25 
 
 
189 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  43.32 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  44.26 
 
 
189 aa  171  5e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  41.18 
 
 
189 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  43.65 
 
 
188 aa  169  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  41.18 
 
 
189 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  42.08 
 
 
189 aa  167  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  42.78 
 
 
188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  44.1 
 
 
207 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  38.71 
 
 
191 aa  155  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  40.98 
 
 
185 aa  154  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  42.08 
 
 
185 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  38.17 
 
 
186 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  40.98 
 
 
185 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  39.89 
 
 
185 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  39.89 
 
 
187 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  39.89 
 
 
187 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  148  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  39.89 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  39.34 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  39.89 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  39.89 
 
 
185 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  38.8 
 
 
187 aa  145  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  36.41 
 
 
190 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  39.67 
 
 
185 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  38.25 
 
 
190 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  37.99 
 
 
187 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  39.34 
 
 
186 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  39.23 
 
 
185 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  40.44 
 
 
188 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  38.8 
 
 
186 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  37.99 
 
 
187 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  36.67 
 
 
187 aa  141  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  37.7 
 
 
185 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  37.7 
 
 
185 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  38.8 
 
 
186 aa  140  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  38.25 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  38.8 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  36.41 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  36.96 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  36.96 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  38.59 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  36.41 
 
 
185 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>