More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0196 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  43.78 
 
 
190 aa  168  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  43.32 
 
 
187 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  38.71 
 
 
186 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  41.18 
 
 
187 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  42.86 
 
 
188 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  38.71 
 
 
211 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  41.4 
 
 
187 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  38.71 
 
 
186 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  45.6 
 
 
188 aa  155  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  41.94 
 
 
188 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  41.94 
 
 
187 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  43.17 
 
 
188 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  42.16 
 
 
189 aa  149  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  41.4 
 
 
187 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  43.01 
 
 
186 aa  148  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  43.01 
 
 
186 aa  148  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  42.16 
 
 
188 aa  148  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  42.16 
 
 
189 aa  147  6e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  40.11 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  40.54 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  40.32 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  40.11 
 
 
188 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  39.78 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  39.57 
 
 
187 aa  144  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  40.11 
 
 
189 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  39.25 
 
 
187 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  39.46 
 
 
187 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  39.46 
 
 
187 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  38.92 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  37.84 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  38.5 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  40 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  36.22 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  36.9 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  39.46 
 
 
188 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  37.84 
 
 
188 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  35.87 
 
 
186 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  37.3 
 
 
188 aa  138  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  38.5 
 
 
188 aa  137  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  38.38 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  38.92 
 
 
188 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  38.59 
 
 
185 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  34.76 
 
 
188 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  36.9 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  38.04 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  36.41 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  36.9 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  38.92 
 
 
188 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  37.77 
 
 
189 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  37.3 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  36.96 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  37.3 
 
 
188 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  37.3 
 
 
188 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  36.41 
 
 
187 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  38.67 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  38.04 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  35.87 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  34.76 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  39.23 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  36.96 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  38.67 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  34.05 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  38.67 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  38.67 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  38.67 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  38.67 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  36.96 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  38.67 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  37.57 
 
 
185 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  36.96 
 
 
185 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  35.91 
 
 
186 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  37.5 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  36.81 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  38.12 
 
 
185 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  38.12 
 
 
185 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  36.76 
 
 
186 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  38.12 
 
 
185 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  37.5 
 
 
185 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  36.96 
 
 
186 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  36.41 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  36.7 
 
 
189 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  37.02 
 
 
185 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  36.41 
 
 
185 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  34.78 
 
 
185 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  36.96 
 
 
186 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  36.41 
 
 
186 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  38.33 
 
 
185 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  34.24 
 
 
185 aa  121  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  35.33 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  36.46 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  35.87 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  36.26 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  36.41 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  35.23 
 
 
187 aa  118  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0968  translation elongation factor P  36.41 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  34.81 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  35.68 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>