More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0968 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0968  translation elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0219  translation elongation factor P  41.05 
 
 		 192 aa  158  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000139055  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  40.22 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  38.59 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  39.67 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  42.13 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  38.17 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  38.92 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  40.91 
 
 		 189 aa  148  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  40.56 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  39.13 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  40.11 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  40.33 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  41.11 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  39.23 
 
 		 187 aa  144  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  38.17 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  38.38 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  40.56 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  37.1 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  36.02 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  38.38 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  36.76 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  38.12 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  40.44 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  140  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  38.59 
 
 		 213 aa  140  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  38.59 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  40.56 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  41.11 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  41.32 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  40.56 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  41.32 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  37.02 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  39.89 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  38.38 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  38.67 
 
 		 199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  37.3 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  38.67 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  39.76 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  37.84 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  37.63 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  37.5 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  37.5 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  37.91 
 
 		 216 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  36.87 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  40 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  36.41 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  37.63 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  40.34 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  37.1 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  37.84 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  38.38 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  37.1 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  37.97 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  39.67 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  37.63 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  37.84 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  37.1 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  40.68 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  36.41 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  32.97 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  39.44 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  39.44 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  38.32 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  38.32 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  38.32 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  39.44 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  39.44 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  39.44 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  38.89 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  38.92 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>