More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3710 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  83.51 
 
 		 188 aa  328  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  72.04 
 
 		 187 aa  291  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  72.43 
 
 		 186 aa  290  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  72.97 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  71.89 
 
 		 186 aa  286  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  69.57 
 
 		 190 aa  281  5.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  68.28 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  64.71 
 
 		 188 aa  251  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  61.08 
 
 		 187 aa  238  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  59.14 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  58.82 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  58.29 
 
 		 213 aa  234  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  58.82 
 
 		 187 aa  233  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  58.06 
 
 		 187 aa  231  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  58.29 
 
 		 187 aa  231  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  57.53 
 
 		 187 aa  227  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  57.53 
 
 		 187 aa  227  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  58.06 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  49.2 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  49.73 
 
 		 188 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  45.16 
 
 		 188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  45.7 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  45.16 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  42.47 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  44.15 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  44.63 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  43.09 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  41.49 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  41.18 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  41.4 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  40.43 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  40.64 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  40.96 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  43.17 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  41.08 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  40.54 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  43.09 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  42.78 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  40.44 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  40.45 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  40.44 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  40.44 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  39.46 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  40.98 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  41.99 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  40.98 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  39.89 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  40.98 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  39.34 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  41.44 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  37.78 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  39.34 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  39.89 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  39.89 
 
 		 185 aa  144  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  37.22 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  39.34 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  40.98 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  39.89 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  39.89 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  38.12 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  40.44 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  38.46 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  39.34 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  38.59 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  39.89 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  37.22 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  36.96 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  38.8 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  38.76 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  38.67 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  38.33 
 
 		 187 aa  138  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>