More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3194 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  94.15 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  93.55 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  88.83 
 
 		 188 aa  352  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  88.83 
 
 		 188 aa  351  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  87.77 
 
 		 188 aa  349  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  81.38 
 
 		 189 aa  318  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  75.53 
 
 		 188 aa  311  4.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  75 
 
 		 188 aa  309  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  76.06 
 
 		 189 aa  306  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  303  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  76.06 
 
 		 188 aa  303  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  73.4 
 
 		 216 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  298  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  71.81 
 
 		 188 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  71.81 
 
 		 189 aa  293  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  72.87 
 
 		 189 aa  291  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  71.81 
 
 		 189 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  69.84 
 
 		 189 aa  284  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  280  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  66.14 
 
 		 189 aa  276  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  67.38 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  49.2 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  49.73 
 
 		 188 aa  190  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  45.7 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  45.16 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  45.7 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  44.15 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  45.7 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  44.62 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  44.39 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  44.39 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  44.62 
 
 		 189 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  41.94 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  41.94 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  40.54 
 
 		 213 aa  167  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  42.7 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  40.54 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  41.08 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  41.62 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  38.04 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  38.04 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  38.04 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  35.68 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  39.13 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  39.33 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  35.33 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  37.3 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  37.3 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  39.11 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  37.1 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  37.16 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  38.04 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  38.04 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  38.04 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  35.36 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  34.78 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  38.55 
 
 		 185 aa  134  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  35.14 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  36.96 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  41.21 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  37.16 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  35.91 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  38.04 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  37.16 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  35.36 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  35.87 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  37.16 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  37.16 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  37.16 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  35.2 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  36.9 
 
 		 211 aa  131  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  35.2 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  35.2 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  36.46 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  36.96 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  35.96 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  37.43 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  38.33 
 
 		 188 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>