More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0479 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  98.94 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  79.14 
 
 		 207 aa  294  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  72.87 
 
 		 189 aa  290  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  71.81 
 
 		 189 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  71.81 
 
 		 189 aa  287  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  69.68 
 
 		 188 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  70.74 
 
 		 188 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  71.28 
 
 		 189 aa  281  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  69.15 
 
 		 189 aa  281  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  69.68 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  68.62 
 
 		 188 aa  277  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  67.55 
 
 		 188 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  68.82 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  66.49 
 
 		 188 aa  273  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  66.49 
 
 		 188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  66.14 
 
 		 189 aa  264  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  63.83 
 
 		 188 aa  261  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  63.49 
 
 		 189 aa  258  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  62.77 
 
 		 216 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  44.09 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  43.55 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  42.47 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  41.94 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  42.47 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  46.52 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  40.43 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  47.06 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  44.09 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  43.01 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  42.78 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  38.92 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  41.08 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  38.92 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  40.11 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  37.3 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  42.7 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  37.5 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  36.41 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  36.41 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  38.04 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  39.13 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  39.67 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  39.11 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  36.26 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  37.3 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  37.22 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  34.43 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  34.43 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  32.98 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  35.14 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  33.33 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  34.44 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  37.16 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  33.88 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  36.26 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  33.88 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  34.24 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  35.56 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  32.07 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  35.2 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  33.88 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  34.95 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  32.24 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  33.7 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  33.7 
 
 		 185 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  32.6 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  34.25 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  34.95 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  36.46 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  33.89 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  35.91 
 
 		 187 aa  121  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  32.78 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  33.52 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  34.25 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  34.25 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  34.44 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  33.88 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  33.88 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  34.25 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  34.25 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  31.69 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  31.72 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  31.69 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  34.25 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  33.7 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0874  Elongation factor P  36.41 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>